ANKRD17 (ankyrin repeat domain 17)
|
Gene
Gene information from NCBI Gene database.
|
|
| Entrez ID | 26057 |
| Gene name | Ankyrin repeat domain 17 |
| Gene symbol | ANKRD17 |
| Synonyms (NCBI Gene) |
CAGSGTARMASK2NY-BR-16
|
| Chromosome | 4 |
| Chromosome location | 4q13.3 |
| Summary | The protein encoded by this gene belongs to the family of ankyrin repeat-containing proteins, and contains two distinct arrays of ankyrin repeats in its amino-terminal region, one with 15 ankyrin repeats, and the other with 10 ankyrin repeats. It also con |
|
miRNA
miRNA information provided by mirtarbase database.
272
|
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||
|
Gene ontology (GO)
Gene Ontology (GO) annotations describing the biological processes, molecular functions, and cellular components associated with a gene.
26
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
|
Other IDs
Other IDs provides unique identifiers for this gene in OMIM, HGNC, and Ensembl databases.
|
|||||||
|
|||||||
|
Protein
Protein information from UniProt database.
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
UniProt ID
Unique identifier for the protein in the UniProt database. Click to view detailed protein information.
|
O75179 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein name | Ankyrin repeat domain-containing protein 17 (Gene trap ankyrin repeat protein) (Serologically defined breast cancer antigen NY-BR-16) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein function | Could play pivotal roles in cell cycle and DNA regulation (PubMed:19150984). Involved in innate immune defense against viruse by positively regulating the viral dsRNA receptors DDX58 and IFIH1 signaling pathways (PubMed:22328336). Involves in NO | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Family and domains |
Pfam
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue specificity | TISSUE SPECIFICITY: Ubiquitously expressed. {ECO:0000269|PubMed:17276651, ECO:0000269|PubMed:19150984}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence length | 2603 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Interactions | View interactions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Associated diseases
Disease associations from ClinVar (causal & non-causal) and other databases (OMIM, Orphanet, GWAS, etc.).
9
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Evidence Score:
★☆☆☆☆ Gene-disease association found in Text Mining only
★★☆☆☆ Found in Text Mining and Unknown/Other Associations
★★★☆☆ Reported in Unknown/Other Associations across ≥2 Sources
★★★★☆ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (<5 Variants)
★★★★★ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (≥5 Variants)
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||