TET3 (tet methylcytosine dioxygenase 3)
| Gene | |
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Entrez ID
Entrez Gene ID - the GENE ID in NCBI Gene database.
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200424 |
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Gene name
Gene Name - the full gene name approved by the HGNC.
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Tet methylcytosine dioxygenase 3 |
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Gene symbol
Gene Symbol - the official gene symbol approved by the HGNC.
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TET3 |
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Synonyms (NCBI Gene)
Gene synonyms aliases
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BEFAHRS, hCG_40738 |
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Chromosome
Chromosome number
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2 |
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Chromosome location
Chromosomal Location - indicates the cytogenetic location of the gene or region on the chromosome.
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2p13.1 |
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Summary
Summary of gene provided in NCBI Entrez Gene.
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Members of the ten-eleven translocation (TET) gene family, including TET3, play a role in the DNA methylation process (Langemeijer et al., 2009 [PubMed 19923888]).[supplied by OMIM, Nov 2010] |
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SNPs
SNP information provided by dbSNP.
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miRNA
miRNA information provided by mirtarbase database.
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Gene ontology (GO)
Gene ontology information of associated ontologies with gene provided by GO database.
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Other IDs
Other ids provides unique ids of gene in databases such as OMIM, HGNC, ENSEMBLE.
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| Protein | |||||||||||
| UniProt ID | O43151 | ||||||||||
| Protein name | Methylcytosine dioxygenase TET3 (EC 1.14.11.80) | ||||||||||
| Protein function | Dioxygenase that catalyzes the conversion of the modified genomic base 5-methylcytosine (5mC) into 5-hydroxymethylcytosine (5hmC) and plays a key role in epigenetic chromatin reprogramming in the zygote following fertilization (PubMed:31928709). | ||||||||||
| PDB | 4Z3C , 8U2Y | ||||||||||
| Family and domains |
Pfam
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| Tissue specificity | TISSUE SPECIFICITY: Expressed in colon, muscle, adrenal gland and peripheral blood lymphocytes. {ECO:0000269|PubMed:12646957}. | ||||||||||
| Sequence |
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| Sequence length | 1795 | ||||||||||
| Interactions | View interactions | ||||||||||
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Associated diseases
Disease associations categorized as Causal (pathogenic variants), Unknown (uncertain genetic evidence), or Text Mining (literature-based associations)
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