COL9A2 (collagen type IX alpha 2 chain)
| Gene | |
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Entrez ID
Entrez Gene ID - the GENE ID in NCBI Gene database.
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1298 |
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Gene name
Gene Name - the full gene name approved by the HGNC.
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Collagen type IX alpha 2 chain |
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Gene symbol
Gene Symbol - the official gene symbol approved by the HGNC.
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COL9A2 |
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Synonyms (NCBI Gene)
Gene synonyms aliases
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DJ39G22.4, EDM2, MED, STL5 |
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Chromosome
Chromosome number
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1 |
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Chromosome location
Chromosomal Location - indicates the cytogenetic location of the gene or region on the chromosome.
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1p34.2 |
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Summary
Summary of gene provided in NCBI Entrez Gene.
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This gene encodes one of the three alpha chains of type IX collagen, the major collagen component of hyaline cartilage. Type IX collagen, a heterotrimeric molecule, is usually found in tissues containing type II collagen, a fibrillar collagen. This chain |
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SNPs
SNP information provided by dbSNP.
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miRNA
miRNA information provided by mirtarbase database.
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Gene ontology (GO)
Gene ontology information of associated ontologies with gene provided by GO database.
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Other IDs
Other ids provides unique ids of gene in databases such as OMIM, HGNC, ENSEMBLE.
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| Protein | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniProt ID | Q14055 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein name | Collagen alpha-2(IX) chain | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein function | Structural component of hyaline cartilage and vitreous of the eye. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDB | 5CTD , 5CTI , 5CVA , 5CVB | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Family and domains |
Pfam
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| Sequence | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence length | 689 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Interactions | View interactions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Pathways
Pathway information has different metabolic/signaling pathways associated with genes.
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Associated diseases
Disease associations categorized as Causal (pathogenic variants), Unknown (uncertain genetic evidence), or Text Mining (literature-based associations)
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