TBC1D20 (TBC1 domain family member 20)
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Gene
Gene information from NCBI Gene database.
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| Entrez ID | 128637 |
| Gene name | TBC1 domain family member 20 |
| Gene symbol | TBC1D20 |
| Synonyms (NCBI Gene) |
C20orf140WARBM4
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| Chromosome | 20 |
| Chromosome location | 20p13 |
| Summary | This gene encodes a protein that belongs to a family of GTPase activator proteins of Rab-like small GTPases. The encoded protein and its cognate GTPase, Rab1, bind the nonstructural protein 5A (NS5A) of the hepatitis C virus (HCV) to mediate viral replica |
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SNPs
SNP information provided by dbSNP.
5
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miRNA
miRNA information provided by mirtarbase database.
981
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Gene ontology (GO)
Gene Ontology (GO) annotations describing the biological processes, molecular functions, and cellular components associated with a gene.
34
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Other IDs
Other IDs provides unique identifiers for this gene in OMIM, HGNC, and Ensembl databases.
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Protein
Protein information from UniProt database.
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UniProt ID
Unique identifier for the protein in the UniProt database. Click to view detailed protein information.
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Q96BZ9 | ||||||||||
| Protein name | TBC1 domain family member 20 | ||||||||||
| Protein function | GTPase-activating protein (GAP) specific for Rab1 and Rab2 small GTPase families for which it can accelerate the intrinsic GTP hydrolysis rate by more than five orders of magnitude (PubMed:23236136). Also shows GAP activity for RAB18 GTPase (Pub | ||||||||||
| PDB | 4HL4 , 4HLQ | ||||||||||
| Family and domains |
Pfam
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| Sequence |
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| Sequence length | 403 | ||||||||||
| Interactions | View interactions | ||||||||||
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Pathways
Pathway information has different metabolic/signaling pathways associated with genes.
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Associated diseases
Disease associations from ClinVar categorized as Causal (Pathogenic/Likely Pathogenic) or Unknown.
19
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