CPSF6 (cleavage and polyadenylation specific factor 6)
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Gene
Gene information from NCBI Gene database.
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| Entrez ID | 11052 |
| Gene name | Cleavage and polyadenylation specific factor 6 |
| Gene symbol | CPSF6 |
| Synonyms (NCBI Gene) |
CFIMCFIM68CFIM72HPBRII-4HPBRII-7
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| Chromosome | 12 |
| Chromosome location | 12q15 |
| Summary | The protein encoded by this gene is one subunit of a cleavage factor required for 3` RNA cleavage and polyadenylation processing. The interaction of the protein with the RNA is one of the earliest steps in the assembly of the 3` end processing complex and |
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miRNA
miRNA information provided by mirtarbase database.
1104
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Gene ontology (GO)
Gene Ontology (GO) annotations describing the biological processes, molecular functions, and cellular components associated with a gene.
36
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Other IDs
Other IDs provides unique identifiers for this gene in OMIM, HGNC, and Ensembl databases.
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Protein
Protein information from UniProt database.
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UniProt ID
Unique identifier for the protein in the UniProt database. Click to view detailed protein information.
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Q16630 | ||||||||||
| Protein name | Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6 (Cleavage and polyadenylation specificity factor 68 kDa subunit) (CPSF 68 kDa subunit) (Cleavage factor Im complex 68 kDa subunit) (CFIm68) (Pre-mRNA cleavage factor Im 68 kDa subunit) (Protein HPB | ||||||||||
| Protein function | Component of the cleavage factor Im (CFIm) complex that functions as an activator of the pre-mRNA 3'-end cleavage and polyadenylation processing required for the maturation of pre-mRNA into functional mRNAs (PubMed:14690600, PubMed:29276085, Pub | ||||||||||
| PDB | 3P5T , 3P6Y , 3Q2S , 3Q2T , 4B4N , 4U0A , 4U0B , 4WYM , 6AY9 , 6GX9 , 7SNQ , 7ZUD , 8CL1 , 8EJL , 8GDV , 9CNV | ||||||||||
| Family and domains |
Pfam
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| Sequence |
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| Sequence length | 551 | ||||||||||
| Interactions | View interactions | ||||||||||
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Pathways
Pathway information has different metabolic/signaling pathways associated with genes.
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Associated diseases
Disease associations from ClinVar (causal & non-causal) and other databases (OMIM, Orphanet, GWAS, etc.).
13
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Evidence Score:
★☆☆☆☆ Gene-disease association found in Text Mining only
★★☆☆☆ Found in Text Mining and Unknown/Other Associations
★★★☆☆ Reported in Unknown/Other Associations across ≥2 Sources
★★★★☆ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (<5 Variants)
★★★★★ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (≥5 Variants)
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