CTDSP2 (CTD small phosphatase 2)
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Gene
Gene information from NCBI Gene database.
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| Entrez ID | 10106 |
| Gene name | CTD small phosphatase 2 |
| Gene symbol | CTDSP2 |
| Synonyms (NCBI Gene) |
OS4PSR2SCP2
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| Chromosome | 12 |
| Chromosome location | 12q14.1 |
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miRNA
miRNA information provided by mirtarbase database.
1104
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Gene ontology (GO)
Gene Ontology (GO) annotations describing the biological processes, molecular functions, and cellular components associated with a gene.
14
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Other IDs
Other IDs provides unique identifiers for this gene in OMIM, HGNC, and Ensembl databases.
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Protein
Protein information from UniProt database.
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UniProt ID
Unique identifier for the protein in the UniProt database. Click to view detailed protein information.
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O14595 | ||||||||||
| Protein name | Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2 (EC 3.1.3.16) (Nuclear LIM interactor-interacting factor 2) (NLI-interacting factor 2) (Protein OS-4) (Small C-terminal domain phosphatase 2) (Small CTD phosphatase 2) (SCP2) | ||||||||||
| Protein function | Preferentially catalyzes the dephosphorylation of 'Ser-5' within the tandem 7 residue repeats in the C-terminal domain (CTD) of the largest RNA polymerase II subunit POLR2A. Negatively regulates RNA polymerase II transcription, possibly by contr | ||||||||||
| PDB | 2Q5E | ||||||||||
| Family and domains |
Pfam
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| Tissue specificity | TISSUE SPECIFICITY: Expression is restricted to non-neuronal tissues. Highest expression in pancreas and lowest in liver. {ECO:0000269|PubMed:15681389}. | ||||||||||
| Sequence |
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| Sequence length | 271 | ||||||||||
| Interactions | View interactions | ||||||||||
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Pathways
Pathway information has different metabolic/signaling pathways associated with genes.
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Associated diseases
Disease associations from ClinVar (causal & non-causal) and other databases (OMIM, Orphanet, GWAS, etc.).
9
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Evidence Score:
★☆☆☆☆ Gene-disease association found in Text Mining only
★★☆☆☆ Found in Text Mining and Unknown/Other Associations
★★★☆☆ Reported in Unknown/Other Associations across ≥2 Sources
★★★★☆ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (<5 Variants)
★★★★★ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (≥5 Variants)
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