TNRC6C (trinucleotide repeat containing adaptor 6C)
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Gene
Gene information from NCBI Gene database.
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| Entrez ID | 57690 |
| Gene name | Trinucleotide repeat containing adaptor 6C |
| Gene symbol | TNRC6C |
| Synonyms (NCBI Gene) |
-
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| Chromosome | 17 |
| Chromosome location | 17q25.3 |
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miRNA
miRNA information provided by mirtarbase database.
1200
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Gene ontology (GO)
Gene Ontology (GO) annotations describing the biological processes, molecular functions, and cellular components associated with a gene.
16
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Other IDs
Other IDs provides unique identifiers for this gene in OMIM, HGNC, and Ensembl databases.
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Protein
Protein information from UniProt database.
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UniProt ID
Unique identifier for the protein in the UniProt database. Click to view detailed protein information.
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Q9HCJ0 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein name | Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein function | Plays a role in RNA-mediated gene silencing by micro-RNAs (miRNAs). Required for miRNA-dependent translational repression of complementary mRNAs by argonaute family proteins. As scaffoldng protein associates with argonaute proteins bound to part | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PDB | 2DKL , 2X04 , 3KTP , 7RUQ | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Family and domains |
Pfam
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| Sequence |
MATGSAQGNFTGHTKKTNGNNGTNGALVQSPSNQSALGAGGANSNGSAARVWGVATGSSS |
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| Sequence length | 1690 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Interactions | View interactions | ||||||||||||||||||||||||||||||
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Associated diseases
Disease associations from ClinVar (causal & non-causal) and other databases (OMIM, Orphanet, GWAS, etc.).
5
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Evidence Score:
★☆☆☆☆ Gene-disease association found in Text Mining only
★★☆☆☆ Found in Text Mining and Unknown/Other Associations
★★★☆☆ Reported in Unknown/Other Associations across ≥2 Sources
★★★★☆ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (<5 Variants)
★★★★★ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (≥5 Variants)
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Related Genes
Genes most often co-reported with TNRC6C across shared curated disease and pathway associations.
5
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Sort by:
TNRC6B
15 shared pathwaysTP53 Regulates Metabolic Genes, Pre-NOTCH Transcription and Translation, Oxidative Stress Induced Senescence, NR1H3 & NR1H2 regulate gene expression linked to cholesterol transport and efflux, Oncogene Induced Senescence, MAPK6/MAPK4 signaling, Regulation of RUNX1 Expression and Activity, Estrogen-dependent gene expression, RUNX1 regulates genes involved in megakaryocyte differentiation and platelet function, Transcriptional Regulation by VENTX, Ca2+ pathway, Post-transcriptional silencing by small RNAs +3 more
Related via 15 shared pathways including TP53 Regulates Metabolic Genes, Pre-NOTCH Transcription and Translation.
TNRC6A
15 shared pathwaysTP53 Regulates Metabolic Genes, Pre-NOTCH Transcription and Translation, Oxidative Stress Induced Senescence, NR1H3 & NR1H2 regulate gene expression linked to cholesterol transport and efflux, Oncogene Induced Senescence, MAPK6/MAPK4 signaling, Regulation of RUNX1 Expression and Activity, Estrogen-dependent gene expression, RUNX1 regulates genes involved in megakaryocyte differentiation and platelet function, Transcriptional Regulation by VENTX, Ca2+ pathway, Post-transcriptional silencing by small RNAs +3 more
Related via 15 shared pathways including TP53 Regulates Metabolic Genes, Pre-NOTCH Transcription and Translation.
MOV10
14 shared pathwaysTP53 Regulates Metabolic Genes, Pre-NOTCH Transcription and Translation, Oxidative Stress Induced Senescence, NR1H3 & NR1H2 regulate gene expression linked to cholesterol transport and efflux, Oncogene Induced Senescence, MAPK6/MAPK4 signaling, Regulation of RUNX1 Expression and Activity, Estrogen-dependent gene expression, RUNX1 regulates genes involved in megakaryocyte differentiation and platelet function, Transcriptional Regulation by VENTX, Ca2+ pathway, Regulation of PTEN mRNA translation +2 more
Related via 14 shared pathways including TP53 Regulates Metabolic Genes, Pre-NOTCH Transcription and Translation.
AGO3
15 shared pathwaysTP53 Regulates Metabolic Genes, Pre-NOTCH Transcription and Translation, Oxidative Stress Induced Senescence, NR1H3 & NR1H2 regulate gene expression linked to cholesterol transport and efflux, Oncogene Induced Senescence, MAPK6/MAPK4 signaling, Regulation of RUNX1 Expression and Activity, Estrogen-dependent gene expression, RUNX1 regulates genes involved in megakaryocyte differentiation and platelet function, Transcriptional Regulation by VENTX, Ca2+ pathway, Post-transcriptional silencing by small RNAs +3 more
Related via 15 shared pathways including TP53 Regulates Metabolic Genes, Pre-NOTCH Transcription and Translation.
AGO4
15 shared pathwaysTP53 Regulates Metabolic Genes, Pre-NOTCH Transcription and Translation, Oxidative Stress Induced Senescence, NR1H3 & NR1H2 regulate gene expression linked to cholesterol transport and efflux, Oncogene Induced Senescence, MAPK6/MAPK4 signaling, Regulation of RUNX1 Expression and Activity, Estrogen-dependent gene expression, RUNX1 regulates genes involved in megakaryocyte differentiation and platelet function, Transcriptional Regulation by VENTX, Ca2+ pathway, Post-transcriptional silencing by small RNAs +3 more
Related via 15 shared pathways including TP53 Regulates Metabolic Genes, Pre-NOTCH Transcription and Translation.
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Diseases Linked via Similar Genes
Diseases curated for genes most similar to TNRC6C (see Related Genes above), that are NOT already directly curated for TNRC6C itself -- a lead worth checking, not a confirmed association.
5
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Autism
Linked via 2 of 5 related genesTNRC6B, TNRC6A
Hypertension
Linked via 2 of 5 related genesTNRC6A, MOV10
Breast cancer
Linked via 1 of 5 related genesTNRC6B
Cholecystolithiasis
Linked via 1 of 5 related genesTNRC6B
Colonic neoplasms
Linked via 1 of 5 related genesTNRC6B
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