TNRC6A (trinucleotide repeat containing adaptor 6A)
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Gene
Gene information from NCBI Gene database.
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| Entrez ID | 27327 |
| Gene name | Trinucleotide repeat containing adaptor 6A |
| Gene symbol | TNRC6A |
| Synonyms (NCBI Gene) |
CAGH26FAME6GW1GW182TNRC6
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| Chromosome | 16 |
| Chromosome location | 16p12.1 |
| Summary | This gene encodes a member of the trinucleotide repeat containing 6 protein family. The protein functions in post-transcriptional gene silencing through the RNA interference (RNAi) and microRNA pathways. The protein associates with messenger RNAs and Argo |
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miRNA
miRNA information provided by mirtarbase database.
1735
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Gene ontology (GO)
Gene Ontology (GO) annotations describing the biological processes, molecular functions, and cellular components associated with a gene.
28
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Other IDs
Other IDs provides unique identifiers for this gene in OMIM, HGNC, and Ensembl databases.
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Protein
Protein information from UniProt database.
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UniProt ID
Unique identifier for the protein in the UniProt database. Click to view detailed protein information.
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Q8NDV7 | ||||||||||||||||||||
| Protein name | Trinucleotide repeat-containing gene 6A protein (CAG repeat protein 26) (EMSY interactor protein) (GW182 autoantigen) (Protein GW1) (Glycine-tryptophan protein of 182 kDa) | ||||||||||||||||||||
| Protein function | Plays a role in RNA-mediated gene silencing by both micro-RNAs (miRNAs) and short interfering RNAs (siRNAs). Required for miRNA-dependent repression of translation and for siRNA-dependent endonucleolytic cleavage of complementary mRNAs by argona | ||||||||||||||||||||
| PDB | 5W6V , 7RUP | ||||||||||||||||||||
| Family and domains |
Pfam
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| Tissue specificity | TISSUE SPECIFICITY: Ubiquitous. {ECO:0000269|PubMed:11950943, ECO:0000269|PubMed:29507423}. | ||||||||||||||||||||
| Sequence |
MRELEAKATKDVERNLSRDLVQEEEQLMEEKKKKKDDKKKKEAAQKKATEQKIKVPEQIK |
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| Sequence length | 1962 | ||||||||||||||||||||
| Interactions | View interactions | ||||||||||||||||||||
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Associated diseases
Disease associations from ClinVar (causal & non-causal) and other databases (OMIM, Orphanet, GWAS, etc.).
17
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Evidence Score:
★☆☆☆☆ Gene-disease association found in Text Mining only
★★☆☆☆ Found in Text Mining and Unknown/Other Associations
★★★☆☆ Reported in Unknown/Other Associations across ≥2 Sources
★★★★☆ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (<5 Variants)
★★★★★ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (≥5 Variants)
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Related Genes
Genes most often co-reported with TNRC6A across shared curated disease and pathway associations.
5
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Sort by:
RAPGEF2
3 shared diseasesMyoclonic epilepsy, Familial adult myoclonic epilepsy, Adult myoclonic epilepsy 7 shared evidence sourcesCTD (Myoclonic epilepsy), ClinVar (Familial adult myoclonic epilepsy), Disgenet (Familial adult myoclonic epilepsy), GWAS catalog (Familial adult myoclonic epilepsy), HPO (Familial adult myoclonic epilepsy), Orphanet (Adult myoclonic epilepsy), Disgenet (Myoclonic epilepsy)
Related via 3 shared diseases including Myoclonic epilepsy, Familial adult myoclonic epilepsy — evidence mostly Disgenet.
SAMD12
3 shared diseasesMyoclonic epilepsy, Familial adult myoclonic epilepsy, Adult myoclonic epilepsy 7 shared evidence sourcesCTD (Myoclonic epilepsy), ClinVar (Familial adult myoclonic epilepsy), Disgenet (Familial adult myoclonic epilepsy), GWAS catalog (Familial adult myoclonic epilepsy), HPO (Familial adult myoclonic epilepsy), Orphanet (Adult myoclonic epilepsy), Disgenet (Myoclonic epilepsy)
Related via 3 shared diseases including Myoclonic epilepsy, Familial adult myoclonic epilepsy — evidence mostly Disgenet.
MARCHF6
2 shared diseasesFamilial adult myoclonic epilepsy, Adult myoclonic epilepsy 4 shared evidence sourcesClinVar (Familial adult myoclonic epilepsy), Disgenet (Familial adult myoclonic epilepsy), HPO (Familial adult myoclonic epilepsy), Orphanet (Adult myoclonic epilepsy)
Related via 2 shared diseases including Familial adult myoclonic epilepsy, Adult myoclonic epilepsy — evidence mostly ClinVar.
TNRC6B
15 shared pathwaysTP53 Regulates Metabolic Genes, Pre-NOTCH Transcription and Translation, Oxidative Stress Induced Senescence, NR1H3 & NR1H2 regulate gene expression linked to cholesterol transport and efflux, Oncogene Induced Senescence, MAPK6/MAPK4 signaling, Regulation of RUNX1 Expression and Activity, Estrogen-dependent gene expression, RUNX1 regulates genes involved in megakaryocyte differentiation and platelet function, Transcriptional Regulation by VENTX, Ca2+ pathway, Post-transcriptional silencing by small RNAs +3 more
Related via 15 shared pathways including TP53 Regulates Metabolic Genes, Pre-NOTCH Transcription and Translation.
TNRC6C
15 shared pathwaysTP53 Regulates Metabolic Genes, Pre-NOTCH Transcription and Translation, Oxidative Stress Induced Senescence, NR1H3 & NR1H2 regulate gene expression linked to cholesterol transport and efflux, Oncogene Induced Senescence, MAPK6/MAPK4 signaling, Regulation of RUNX1 Expression and Activity, Estrogen-dependent gene expression, RUNX1 regulates genes involved in megakaryocyte differentiation and platelet function, Transcriptional Regulation by VENTX, Ca2+ pathway, Post-transcriptional silencing by small RNAs +3 more
Related via 15 shared pathways including TP53 Regulates Metabolic Genes, Pre-NOTCH Transcription and Translation.
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Diseases Linked via Similar Genes
Diseases curated for genes most similar to TNRC6A (see Related Genes above), that are NOT already directly curated for TNRC6A itself -- a lead worth checking, not a confirmed association.
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Benign myoclonic epilepsy
Linked via 2 of 5 related genesSAMD12, MARCHF6
Amyotrophic lateral sclerosis
Linked via 1 of 5 related genesRAPGEF2
Coronary artery disease
Linked via 1 of 5 related genesRAPGEF2
Bone fracture
Linked via 1 of 5 related genesSAMD12
Benign adult familial myoclonic epilepsy
Linked via 1 of 5 related genesSAMD12
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