SERINC5 (serine incorporator 5)
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Gene
Gene information from NCBI Gene database.
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| Entrez ID | 256987 |
| Gene name | Serine incorporator 5 |
| Gene symbol | SERINC5 |
| Synonyms (NCBI Gene) |
C5orf12TPO1
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| Chromosome | 5 |
| Chromosome location | 5q14.1 |
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miRNA
miRNA information provided by mirtarbase database.
766
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Gene ontology (GO)
Gene Ontology (GO) annotations describing the biological processes, molecular functions, and cellular components associated with a gene.
25
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Other IDs
Other IDs provides unique identifiers for this gene in OMIM, HGNC, and Ensembl databases.
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Protein
Protein information from UniProt database.
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UniProt ID
Unique identifier for the protein in the UniProt database. Click to view detailed protein information.
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Q86VE9 | ||||||||||
| Protein name | Serine incorporator 5 | ||||||||||
| Protein function | Restriction factor required to restrict infectivity of lentiviruses, such as HIV-1: acts by inhibiting an early step of viral infection. Impairs the penetration of the viral particle into the cytoplasm (PubMed:26416733, PubMed:26416734). Non-ATP | ||||||||||
| Family and domains |
Pfam
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| Tissue specificity | TISSUE SPECIFICITY: Highly expressed in placenta, skeletal muscle, spleen, thymus, testis and peripheral leukocyte and is expressed weakly in the heart, liver and fetal brain. {ECO:0000269|PubMed:12688535}. | ||||||||||
| Sequence | |||||||||||
| Sequence length | 423 | ||||||||||
| Interactions | View interactions | ||||||||||
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Pathways
Pathway information has different metabolic/signaling pathways associated with genes.
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Associated diseases
Disease associations from ClinVar (causal & non-causal) and other databases (OMIM, Orphanet, GWAS, etc.).
8
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Evidence Score:
★☆☆☆☆ Gene-disease association found in Text Mining only
★★☆☆☆ Found in Text Mining and Unknown/Other Associations
★★★☆☆ Reported in Unknown/Other Associations across ≥2 Sources
★★★★☆ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (<5 Variants)
★★★★★ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (≥5 Variants)
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Diseases Linked via Similar Genes
Diseases curated for genes most similar to SERINC5 (see Related Genes above), that are NOT already directly curated for SERINC5 itself -- a lead worth checking, not a confirmed association.
5
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Breast cancer
Linked via 3 of 5 related genesNYAP2, NOTCH2, PRKG1
Oligodendroglioma
Linked via 3 of 5 related genesNYAP2, PIEZO2, PRKG1
Schizophrenia
Linked via 3 of 5 related genesNYAP2, PIEZO2, PRKG1
Squamous cell carcinoma
Linked via 3 of 5 related genesNYAP2, NOTCH2, PRKG1
Diabetes mellitus type 1
Linked via 3 of 5 related genesNYAP2, NOTCH2, PRKG1
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