RBBP4 (RB binding protein 4, chromatin remodeling factor)
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Gene
Gene information from NCBI Gene database.
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| Entrez ID | 5928 |
| Gene name | RB binding protein 4, chromatin remodeling factor |
| Gene symbol | RBBP4 |
| Synonyms (NCBI Gene) |
NURF55RBAP48lin-53
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| Chromosome | 1 |
| Chromosome location | 1p35.1 |
| Summary | This gene encodes a ubiquitously expressed nuclear protein which belongs to a highly conserved subfamily of WD-repeat proteins. It is present in protein complexes involved in histone acetylation and chromatin assembly. It is part of the Mi-2 complex which |
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miRNA
miRNA information provided by mirtarbase database.
1206
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Gene ontology (GO)
Gene Ontology (GO) annotations describing the biological processes, molecular functions, and cellular components associated with a gene.
59
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Other IDs
Other IDs provides unique identifiers for this gene in OMIM, HGNC, and Ensembl databases.
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Protein
Protein information from UniProt database.
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UniProt ID
Unique identifier for the protein in the UniProt database. Click to view detailed protein information.
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Q09028 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein name | Histone-binding protein RBBP4 (Chromatin assembly factor 1 subunit C) (CAF-1 subunit C) (Chromatin assembly factor I p48 subunit) (CAF-I 48 kDa subunit) (CAF-I p48) (Nucleosome-remodeling factor subunit RBAP48) (Retinoblastoma-binding protein 4) (RBBP-4) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein function | Core histone-binding subunit that may target chromatin assembly factors, chromatin remodeling factors and histone deacetylases to their histone substrates in a manner that is regulated by nucleosomal DNA (PubMed:10866654). Component of the chrom | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDB | 2XU7 , 3GFC , 4PBY , 4PBZ , 4PC0 , 4R7A , 5FXY , 5VTB , 5WAI , 5WAK , 5XWR , 5XXQ , 5Y1U , 6BW3 , 6BW4 , 6C23 , 6C24 , 6G16 , 6NQ3 , 6WKR , 6ZRC , 6ZRD , 7AOA , 7KSO , 7KSR , 7KTP , 7M40 , 7N40 , 7R1D , 7Y5K , 7Y5L , 7Y5O , 7Y5U , 7Y5V , 8EQV , 8FYH , 8IQF , 8IQG , 8T9G , 8TAS , 8TB9 , 8TX8 , 8VMI , 8VML , 8VNV , 8VNZ , 9C8U , 9DCH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Family and domains |
Pfam
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| Tissue specificity | TISSUE SPECIFICITY: Expressed in neuroblastoma cells. {ECO:0000269|PubMed:30026490}. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
MADKEAAFDDAVEERVINEEYKIWKKNTPFLYDLVMTHALEWPSLTAQWLPDVTRPEGKD |
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| Sequence length | 425 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Interactions | View interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Related Genes
Genes most often co-reported with RBBP4 across shared curated disease and pathway associations.
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Sort by:
RBBP7
12 shared pathwaysATP-dependent chromatin remodeling, Polycomb repressive complex, Regulation of TP53 Activity through Acetylation, Deposition of new CENPA-containing nucleosomes at the centromere, Oxidative Stress Induced Senescence, Regulation of PTEN gene transcription, Transcriptional Regulation by E2F6, HCMV Early Events, RNA Polymerase I Transcription Initiation, PRC2 methylates histones and DNA, HDACs deacetylate histones, PKMTs methylate histone lysines
Related via 12 shared pathways including ATP-dependent chromatin remodeling, Polycomb repressive complex.
EED
7 shared pathwaysPolycomb repressive complex, Oxidative Stress Induced Senescence, Regulation of PTEN gene transcription, Transcriptional Regulation by E2F6, HCMV Early Events, PRC2 methylates histones and DNA, PKMTs methylate histone lysines
Related via 7 shared pathways including Polycomb repressive complex, Oxidative Stress Induced Senescence.
LIN54
7 shared pathwaysCellular senescence, Cyclin E associated events during G1/S transition , Cyclin A:Cdk2-associated events at S phase entry, G0 and Early G1, Polo-like kinase mediated events, Transcription of E2F targets under negative control by DREAM complex, G1/S-Specific Transcription
Related via 7 shared pathways including Cellular senescence, Cyclin E associated events during G1/S transition .
LIN9
7 shared pathwaysCellular senescence, Cyclin E associated events during G1/S transition , Cyclin A:Cdk2-associated events at S phase entry, G0 and Early G1, Polo-like kinase mediated events, Transcription of E2F targets under negative control by DREAM complex, G1/S-Specific Transcription
Related via 7 shared pathways including Cellular senescence, Cyclin E associated events during G1/S transition .
LIN37
7 shared pathwaysCellular senescence, Cyclin E associated events during G1/S transition , Cyclin A:Cdk2-associated events at S phase entry, G0 and Early G1, Polo-like kinase mediated events, Transcription of E2F targets under negative control by DREAM complex, G1/S-Specific Transcription
Related via 7 shared pathways including Cellular senescence, Cyclin E associated events during G1/S transition .
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Diseases Linked via Similar Genes
Diseases curated for genes most similar to RBBP4 (see Related Genes above), that are NOT already directly curated for RBBP4 itself -- a lead worth checking, not a confirmed association.
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Prostate cancer
Linked via 1 of 5 related genesRBBP7
Spermatogenic failure, x-linked
Linked via 1 of 5 related genesRBBP7
Attention deficit hyperactivity disorder
Linked via 1 of 5 related genesEED
Autism
Linked via 1 of 5 related genesEED
Cannabis abuse
Linked via 1 of 5 related genesEED
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