TTC39C (tetratricopeptide repeat domain 39C)
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Gene
Gene information from NCBI Gene database.
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| Entrez ID | 125488 |
| Gene name | Tetratricopeptide repeat domain 39C |
| Gene symbol | TTC39C |
| Synonyms (NCBI Gene) |
C18orf17HsT2697
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| Chromosome | 18 |
| Chromosome location | 18q11.2 |
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miRNA
miRNA information provided by mirtarbase database.
668
Show/Hide all (668) |
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Gene ontology (GO)
Gene Ontology (GO) annotations describing the biological processes, molecular functions, and cellular components associated with a gene.
2
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Other IDs
Other IDs provides unique identifiers for this gene in OMIM, HGNC, and Ensembl databases.
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Protein
Protein information from UniProt database.
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UniProt ID
Unique identifier for the protein in the UniProt database. Click to view detailed protein information.
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Q8N584 | ||||||||||
| Protein name | Tetratricopeptide repeat protein 39C (TPR repeat protein 39C) | ||||||||||
| Family and domains |
Pfam
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| Sequence |
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| Sequence length | 583 | ||||||||||
| Interactions | View interactions | ||||||||||
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Associated diseases
Disease associations from ClinVar (causal & non-causal) and other databases (OMIM, Orphanet, GWAS, etc.).
5
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Evidence Score:
★☆☆☆☆ Gene-disease association found in Text Mining only
★★☆☆☆ Found in Text Mining and Unknown/Other Associations
★★★☆☆ Reported in Unknown/Other Associations across ≥2 Sources
★★★★☆ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (<5 Variants)
★★★★★ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (≥5 Variants)
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Diseases Linked via Similar Genes
Diseases curated for genes most similar to TTC39C (see Related Genes above), that are NOT already directly curated for TTC39C itself -- a lead worth checking, not a confirmed association.
5
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Breast cancer
Linked via 5 of 5 related genesKCNH7, TMEM18, TENM2, LSAMP, IGF2BP2
Diabetes mellitus type 2
Linked via 5 of 5 related genesKCNH7, TMEM18, TENM2, LSAMP, IGF2BP2
Colorectal cancer
Linked via 4 of 5 related genesTMEM18, TENM2, LSAMP, IGF2BP2
Lung cancer
Linked via 4 of 5 related genesTMEM18, TENM2, LSAMP, IGF2BP2
Metabolic syndrome
Linked via 4 of 5 related genesTMEM18, TENM2, LSAMP, IGF2BP2
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