PATL1 (PAT1 homolog 1, processing body mRNA decay factor)
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Gene
Gene information from NCBI Gene database.
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| Entrez ID | 219988 |
| Gene name | PAT1 homolog 1, processing body mRNA decay factor |
| Gene symbol | PATL1 |
| Synonyms (NCBI Gene) |
Pat1bhPat1b
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| Chromosome | 11 |
| Chromosome location | 11q12.1 |
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miRNA
miRNA information provided by mirtarbase database.
730
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Gene ontology (GO)
Gene Ontology (GO) annotations describing the biological processes, molecular functions, and cellular components associated with a gene.
23
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Other IDs
Other IDs provides unique identifiers for this gene in OMIM, HGNC, and Ensembl databases.
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Protein
Protein information from UniProt database.
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UniProt ID
Unique identifier for the protein in the UniProt database. Click to view detailed protein information.
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Q86TB9 | ||||||||||
| Protein name | Protein PAT1 homolog 1 (PAT1-like protein 1) (Protein PAT1 homolog b) (Pat1b) (hPat1b) | ||||||||||
| Protein function | RNA-binding protein involved in deadenylation-dependent decapping of mRNAs, leading to the degradation of mRNAs (PubMed:17936923, PubMed:20543818, PubMed:20584987, PubMed:20852261). Acts as a scaffold protein that connects deadenylation and deca | ||||||||||
| PDB | 2XEQ , 2XER , 2XES | ||||||||||
| Family and domains |
Pfam
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| Tissue specificity | TISSUE SPECIFICITY: Ubiquitous. {ECO:0000269|PubMed:17936923}. | ||||||||||
| Sequence |
MFRYESLEDCPLDEDEDAFQGLGEEDEEIDQFNDDTFGSGAVDDDWQEAHERLAELEEKL |
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| Sequence length | 770 | ||||||||||
| Interactions | View interactions | ||||||||||
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Pathways
Pathway information has different metabolic/signaling pathways associated with genes.
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Diseases Linked via Similar Genes
Diseases curated for genes most similar to PATL1 (see Related Genes above), that are NOT already directly curated for PATL1 itself -- a lead worth checking, not a confirmed association.
5
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Non-specific syndromic intellectual disability
Linked via 2 of 5 related genesDDX6, LSM1
Intellectual developmental disorder
Linked via 2 of 5 related genesLSM1, EDC3
Alzheimer disease
Linked via 1 of 5 related genesDDX6
Rheumatoid arthritis
Linked via 1 of 5 related genesDDX6
Asthma
Linked via 1 of 5 related genesDDX6
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