APOBEC3F (apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3F)
Log in to bookmark this gene
Bookmark This Gene
|
Gene
Gene information from NCBI Gene database.
|
|
| Entrez ID | 200316 |
| Gene name | Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3F |
| Gene symbol | APOBEC3F |
| Synonyms (NCBI Gene) |
A3FARP8BK150C2.4.MRNAKA6
|
| Chromosome | 22 |
| Chromosome location | 22q13.1 |
| Summary | This gene is a member of the cytidine deaminase gene family. It is one of seven related genes or pseudogenes found in a cluster, thought to result from gene duplication, on chromosome 22. Members of the cluster encode proteins that are structurally and fu |
|
miRNA
miRNA information provided by mirtarbase database.
653
Show/Hide all (653) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Gene ontology (GO)
Gene Ontology (GO) annotations describing the biological processes, molecular functions, and cellular components associated with a gene.
41
Show/Hide all (41) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Other IDs
Other IDs provides unique identifiers for this gene in OMIM, HGNC, and Ensembl databases.
|
|||||||
|
|||||||
|
Protein
Protein information from UniProt database.
|
||||||||||||||||
|
UniProt ID
Unique identifier for the protein in the UniProt database. Click to view detailed protein information.
|
Q8IUX4 | |||||||||||||||
| Protein name | DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F (EC 3.5.4.38) (Apolipoprotein B mRNA-editing enzyme catalytic polypeptide-like 3F) (A3F) | |||||||||||||||
| Protein function | DNA deaminase (cytidine deaminase) which acts as an inhibitor of retrovirus replication and retrotransposon mobility via deaminase-dependent and -independent mechanisms (PubMed:15141007, PubMed:20062055, PubMed:22915799, PubMed:34774569). Exhibi | |||||||||||||||
| PDB | 3WUS , 4IOU , 4J4J , 5HX4 , 5HX5 , 5W2M , 5ZVA , 5ZVB , 6NIL | |||||||||||||||
| Family and domains |
Pfam
|
|||||||||||||||
| Tissue specificity | TISSUE SPECIFICITY: Widely expressed. Highly expressed in ovary. {ECO:0000269|PubMed:11863358, ECO:0000269|PubMed:15152192, ECO:0000269|PubMed:20308164}. | |||||||||||||||
| Sequence |
MKPHFRNTVERMYRDTFSYNFYNRPILSRRNTVWLCYEVKTKGPSRPRLDAKIFRGQVYS |
|||||||||||||||
| Sequence length | 373 | |||||||||||||||
| Interactions | View interactions | |||||||||||||||
|
Pathways
Pathway information has different metabolic/signaling pathways associated with genes.
|
||||
|
||||
|
Diseases Linked via Similar Genes
Diseases curated for genes most similar to APOBEC3F (see Related Genes above), that are NOT already directly curated for APOBEC3F itself -- a lead worth checking, not a confirmed association.
5
|
|||||||||||||||||||
|
Coronary artery disease
Linked via 1 of 5 related genesTRIM5
Head and neck neoplasms
Linked via 1 of 5 related genesTRIM5
Intracerebral hemorrhage
Linked via 1 of 5 related genesTRIM5
Myocardial infarction
Linked via 1 of 5 related genesTRIM5
Neuroblastoma
Linked via 1 of 5 related genesTRIM5
|
|||||||||||||||||||