ZKSCAN1 (zinc finger with KRAB and SCAN domains 1)
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Gene
Gene information from NCBI Gene database.
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| Entrez ID | 7586 |
| Gene name | Zinc finger with KRAB and SCAN domains 1 |
| Gene symbol | ZKSCAN1 |
| Synonyms (NCBI Gene) |
KOX18PHZ-37ZNF139ZNF36ZSCAN33
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| Chromosome | 7 |
| Chromosome location | 7q22.1 |
| Summary | This gene encodes a member of the Kruppel C2H2-type zinc-finger family of proteins. This encoded protein may function as a transcription factor that regulates the expression of GABA type-A receptors in the brain. Transcripts from this gene have been shown |
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miRNA
miRNA information provided by mirtarbase database.
1337
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Gene ontology (GO)
Gene Ontology (GO) annotations describing the biological processes, molecular functions, and cellular components associated with a gene.
11
Show/Hide all (11) |
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Other IDs
Other IDs provides unique identifiers for this gene in OMIM, HGNC, and Ensembl databases.
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Protein
Protein information from UniProt database.
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UniProt ID
Unique identifier for the protein in the UniProt database. Click to view detailed protein information.
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P17029 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein name | Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1 (Zinc finger protein 139) (Zinc finger protein 36) (Zinc finger protein KOX18) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein function | May be involved in transcriptional regulation. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Family and domains |
Pfam
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| Sequence |
MMTAESREATGLSPQAAQEKDGIVIVKVEEEDEEDHMWGQDSTLQDTPPPDPEIFRQRFR |
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| Sequence length | 563 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Interactions | View interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Pathways
Pathway information has different metabolic/signaling pathways associated with genes.
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Associated diseases
Disease associations from ClinVar (causal & non-causal) and other databases (OMIM, Orphanet, GWAS, etc.).
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Evidence Score:
★☆☆☆☆ Gene-disease association found in Text Mining only
★★☆☆☆ Found in Text Mining and Unknown/Other Associations
★★★☆☆ Reported in Unknown/Other Associations across ≥2 Sources
★★★★☆ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (<5 Variants)
★★★★★ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (≥5 Variants)
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Diseases Linked via Similar Genes
Diseases curated for genes most similar to ZKSCAN1 (see Related Genes above), that are NOT already directly curated for ZKSCAN1 itself -- a lead worth checking, not a confirmed association.
5
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Central nervous system cancer
Linked via 2 of 5 related genesSPDL1, MUC5AC
Glioma
Linked via 2 of 5 related genesSPDL1, MUC5AC
Asthma
Linked via 2 of 5 related genesMUC5AC, MUC2
Astrocytoma
Linked via 1 of 5 related genesSPDL1
Hearing loss
Linked via 1 of 5 related genesSPDL1
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