ZCCHC9 (zinc finger CCHC-type containing 9)

Download as csv Download as pdf

Log in to bookmark this gene

Bookmark This Gene

Title Project / Tag (optional) Note (optional)

Cancel Save

On this page

Gene miRNA Gene ontology Other IDs Protein Related genes Diseases linked via similar genes

Gene

• Entrez ID: 84240
• Gene name: Zinc finger CCHC-type containing 9
• Gene symbol: ZCCHC9
• Synonyms (NCBI Gene): PPP1R41
• Chromosome: 5
• Chromosome location: 5q14.1

miRNA Show/Hide all (307)

miRTarBase ID	miRNA	Experiments	Reference
MIRT052387	hsa-let-7a-5p	CLASH	23622248
MIRT052011	hsa-let-7b-5p	CLASH	23622248
MIRT650120	hsa-miR-548ac	HITS-CLIP	23824327
MIRT650119	hsa-miR-548bb-3p	HITS-CLIP	23824327
MIRT650118	hsa-miR-548d-3p	HITS-CLIP	23824327
MIRT650117	hsa-miR-548h-3p	HITS-CLIP	23824327
MIRT650116	hsa-miR-548z	HITS-CLIP	23824327
MIRT650112	hsa-miR-605-5p	HITS-CLIP	23824327
MIRT650111	hsa-miR-339-5p	HITS-CLIP	23824327
MIRT650120	hsa-miR-548ac	HITS-CLIP	23824327
MIRT650119	hsa-miR-548bb-3p	HITS-CLIP	23824327
MIRT650118	hsa-miR-548d-3p	HITS-CLIP	23824327
MIRT650117	hsa-miR-548h-3p	HITS-CLIP	23824327
MIRT650116	hsa-miR-548z	HITS-CLIP	23824327
MIRT650115	hsa-miR-548aa	HITS-CLIP	23824327
MIRT650114	hsa-miR-548ap-3p	HITS-CLIP	23824327
MIRT650113	hsa-miR-548t-3p	HITS-CLIP	23824327
MIRT650112	hsa-miR-605-5p	HITS-CLIP	23824327
MIRT650111	hsa-miR-339-5p	HITS-CLIP	23824327
MIRT545588	hsa-miR-369-3p	PAR-CLIP	20371350
MIRT545587	hsa-miR-5692b	PAR-CLIP	20371350
MIRT545586	hsa-miR-5692c	PAR-CLIP	20371350
MIRT314657	hsa-miR-374a-5p	PAR-CLIP	20371350
MIRT314658	hsa-miR-374b-5p	PAR-CLIP	20371350
MIRT545585	hsa-miR-7159-3p	PAR-CLIP	20371350
MIRT545584	hsa-miR-4482-3p	PAR-CLIP	20371350
MIRT545591	hsa-miR-3606-3p	PAR-CLIP	21572407
MIRT545590	hsa-miR-513a-3p	PAR-CLIP	21572407
MIRT545589	hsa-miR-513c-3p	PAR-CLIP	21572407
MIRT545588	hsa-miR-369-3p	PAR-CLIP	21572407
MIRT545587	hsa-miR-5692b	PAR-CLIP	21572407
MIRT545586	hsa-miR-5692c	PAR-CLIP	21572407
MIRT314657	hsa-miR-374a-5p	PAR-CLIP	21572407
MIRT314658	hsa-miR-374b-5p	PAR-CLIP	21572407
MIRT552586	hsa-miR-6807-5p	PAR-CLIP	21572407
MIRT545585	hsa-miR-7159-3p	PAR-CLIP	21572407
MIRT545584	hsa-miR-4482-3p	PAR-CLIP	21572407
MIRT552585	hsa-miR-8055	PAR-CLIP	21572407
MIRT545591	hsa-miR-3606-3p	PAR-CLIP	21572407
MIRT545590	hsa-miR-513a-3p	PAR-CLIP	21572407
MIRT545589	hsa-miR-513c-3p	PAR-CLIP	21572407
MIRT545588	hsa-miR-369-3p	PAR-CLIP	21572407
MIRT545587	hsa-miR-5692b	PAR-CLIP	21572407
MIRT545586	hsa-miR-5692c	PAR-CLIP	21572407
MIRT314657	hsa-miR-374a-5p	PAR-CLIP	21572407
MIRT314658	hsa-miR-374b-5p	PAR-CLIP	21572407
MIRT545585	hsa-miR-7159-3p	PAR-CLIP	21572407
MIRT545584	hsa-miR-4482-3p	PAR-CLIP	21572407
MIRT650120	hsa-miR-548ac	HITS-CLIP	23824327
MIRT650119	hsa-miR-548bb-3p	HITS-CLIP	23824327
MIRT650118	hsa-miR-548d-3p	HITS-CLIP	23824327
MIRT650117	hsa-miR-548h-3p	HITS-CLIP	23824327
MIRT650116	hsa-miR-548z	HITS-CLIP	23824327
MIRT650112	hsa-miR-605-5p	HITS-CLIP	23824327
MIRT650111	hsa-miR-339-5p	HITS-CLIP	23824327
MIRT650120	hsa-miR-548ac	HITS-CLIP	23824327
MIRT650119	hsa-miR-548bb-3p	HITS-CLIP	23824327
MIRT650118	hsa-miR-548d-3p	HITS-CLIP	23824327
MIRT650117	hsa-miR-548h-3p	HITS-CLIP	23824327
MIRT650116	hsa-miR-548z	HITS-CLIP	23824327
MIRT650115	hsa-miR-548aa	HITS-CLIP	23824327
MIRT650114	hsa-miR-548ap-3p	HITS-CLIP	23824327
MIRT650113	hsa-miR-548t-3p	HITS-CLIP	23824327
MIRT650112	hsa-miR-605-5p	HITS-CLIP	23824327
MIRT650111	hsa-miR-339-5p	HITS-CLIP	23824327
MIRT545588	hsa-miR-369-3p	PAR-CLIP	20371350
MIRT545587	hsa-miR-5692b	PAR-CLIP	20371350
MIRT545586	hsa-miR-5692c	PAR-CLIP	20371350
MIRT314657	hsa-miR-374a-5p	PAR-CLIP	20371350
MIRT314658	hsa-miR-374b-5p	PAR-CLIP	20371350
MIRT545585	hsa-miR-7159-3p	PAR-CLIP	20371350
MIRT545584	hsa-miR-4482-3p	PAR-CLIP	20371350
MIRT545591	hsa-miR-3606-3p	PAR-CLIP	21572407
MIRT545590	hsa-miR-513a-3p	PAR-CLIP	21572407
MIRT545589	hsa-miR-513c-3p	PAR-CLIP	21572407
MIRT545588	hsa-miR-369-3p	PAR-CLIP	21572407
MIRT545587	hsa-miR-5692b	PAR-CLIP	21572407
MIRT545586	hsa-miR-5692c	PAR-CLIP	21572407
MIRT314657	hsa-miR-374a-5p	PAR-CLIP	21572407
MIRT314658	hsa-miR-374b-5p	PAR-CLIP	21572407
MIRT552586	hsa-miR-6807-5p	PAR-CLIP	21572407
MIRT545585	hsa-miR-7159-3p	PAR-CLIP	21572407
MIRT545584	hsa-miR-4482-3p	PAR-CLIP	21572407
MIRT552585	hsa-miR-8055	PAR-CLIP	21572407
MIRT545591	hsa-miR-3606-3p	PAR-CLIP	21572407
MIRT545590	hsa-miR-513a-3p	PAR-CLIP	21572407
MIRT545589	hsa-miR-513c-3p	PAR-CLIP	21572407
MIRT545588	hsa-miR-369-3p	PAR-CLIP	21572407
MIRT545587	hsa-miR-5692b	PAR-CLIP	21572407
MIRT545586	hsa-miR-5692c	PAR-CLIP	21572407
MIRT314657	hsa-miR-374a-5p	PAR-CLIP	21572407
MIRT314658	hsa-miR-374b-5p	PAR-CLIP	21572407
MIRT545585	hsa-miR-7159-3p	PAR-CLIP	21572407
MIRT545584	hsa-miR-4482-3p	PAR-CLIP	21572407
MIRT1507507	hsa-miR-4659a-3p	CLIP-seq
MIRT1507508	hsa-miR-4659b-3p	CLIP-seq
MIRT1507509	hsa-miR-515-5p	CLIP-seq
MIRT1507510	hsa-let-7a	CLIP-seq
MIRT1507511	hsa-let-7b	CLIP-seq
MIRT1507512	hsa-let-7c	CLIP-seq
MIRT1507513	hsa-let-7d	CLIP-seq
MIRT1507514	hsa-let-7e	CLIP-seq
MIRT1507515	hsa-let-7f	CLIP-seq
MIRT1507516	hsa-let-7g	CLIP-seq
MIRT1507517	hsa-let-7i	CLIP-seq
MIRT1507518	hsa-miR-139-5p	CLIP-seq
MIRT1507519	hsa-miR-196a	CLIP-seq
MIRT1507520	hsa-miR-196b	CLIP-seq
MIRT1507521	hsa-miR-202	CLIP-seq
MIRT1507522	hsa-miR-204	CLIP-seq
MIRT1507523	hsa-miR-211	CLIP-seq
MIRT1507524	hsa-miR-2861	CLIP-seq
MIRT1507525	hsa-miR-2909	CLIP-seq
MIRT1507526	hsa-miR-299-5p	CLIP-seq
MIRT1507527	hsa-miR-3120-3p	CLIP-seq
MIRT1507528	hsa-miR-338-5p	CLIP-seq
MIRT1507529	hsa-miR-3670	CLIP-seq
MIRT1507530	hsa-miR-375	CLIP-seq
MIRT1507531	hsa-miR-410	CLIP-seq
MIRT1507532	hsa-miR-4278	CLIP-seq
MIRT1507533	hsa-miR-4300	CLIP-seq
MIRT1507534	hsa-miR-433	CLIP-seq
MIRT1507535	hsa-miR-4458	CLIP-seq
MIRT1507536	hsa-miR-4500	CLIP-seq
MIRT1507537	hsa-miR-4540	CLIP-seq
MIRT1507538	hsa-miR-4636	CLIP-seq
MIRT1507539	hsa-miR-4755-5p	CLIP-seq
MIRT1507540	hsa-miR-4760-3p	CLIP-seq
MIRT1507541	hsa-miR-4794	CLIP-seq
MIRT1507542	hsa-miR-548a-5p	CLIP-seq
MIRT1507543	hsa-miR-548ab	CLIP-seq
MIRT1507544	hsa-miR-548ak	CLIP-seq
MIRT1507545	hsa-miR-548b-5p	CLIP-seq
MIRT1507546	hsa-miR-548c-5p	CLIP-seq
MIRT1507547	hsa-miR-548d-5p	CLIP-seq
MIRT1507548	hsa-miR-548h	CLIP-seq
MIRT1507549	hsa-miR-548i	CLIP-seq
MIRT1507550	hsa-miR-548j	CLIP-seq
MIRT1507551	hsa-miR-548v	CLIP-seq
MIRT1507552	hsa-miR-548w	CLIP-seq
MIRT1507553	hsa-miR-548y	CLIP-seq
MIRT1507554	hsa-miR-559	CLIP-seq
MIRT1507555	hsa-miR-570	CLIP-seq
MIRT1507556	hsa-miR-579	CLIP-seq
MIRT1507557	hsa-miR-609	CLIP-seq
MIRT1507558	hsa-miR-618	CLIP-seq
MIRT1507559	hsa-miR-623	CLIP-seq
MIRT1507560	hsa-miR-664	CLIP-seq
MIRT1507561	hsa-miR-802	CLIP-seq
MIRT1507562	hsa-miR-920	CLIP-seq
MIRT1507563	hsa-miR-939	CLIP-seq
MIRT1507564	hsa-miR-98	CLIP-seq
MIRT1507510	hsa-let-7a	CLIP-seq
MIRT1507511	hsa-let-7b	CLIP-seq
MIRT1507512	hsa-let-7c	CLIP-seq
MIRT1507513	hsa-let-7d	CLIP-seq
MIRT1507514	hsa-let-7e	CLIP-seq
MIRT1507515	hsa-let-7f	CLIP-seq
MIRT1507516	hsa-let-7g	CLIP-seq
MIRT1507517	hsa-let-7i	CLIP-seq
MIRT1507518	hsa-miR-139-5p	CLIP-seq
MIRT1507519	hsa-miR-196a	CLIP-seq
MIRT1507520	hsa-miR-196b	CLIP-seq
MIRT1507521	hsa-miR-202	CLIP-seq
MIRT1507524	hsa-miR-2861	CLIP-seq
MIRT1507526	hsa-miR-299-5p	CLIP-seq
MIRT1507527	hsa-miR-3120-3p	CLIP-seq
MIRT1507529	hsa-miR-3670	CLIP-seq
MIRT1507533	hsa-miR-4300	CLIP-seq
MIRT1507534	hsa-miR-433	CLIP-seq
MIRT1507535	hsa-miR-4458	CLIP-seq
MIRT1507565	hsa-miR-4473	CLIP-seq
MIRT1507536	hsa-miR-4500	CLIP-seq
MIRT1507537	hsa-miR-4540	CLIP-seq
MIRT1507538	hsa-miR-4636	CLIP-seq
MIRT1507541	hsa-miR-4794	CLIP-seq
MIRT1507566	hsa-miR-512-3p	CLIP-seq
MIRT1507567	hsa-miR-520f	CLIP-seq
MIRT1507542	hsa-miR-548a-5p	CLIP-seq
MIRT1507543	hsa-miR-548ab	CLIP-seq
MIRT1507544	hsa-miR-548ak	CLIP-seq
MIRT1507545	hsa-miR-548b-5p	CLIP-seq
MIRT1507546	hsa-miR-548c-5p	CLIP-seq
MIRT1507547	hsa-miR-548d-5p	CLIP-seq
MIRT1507548	hsa-miR-548h	CLIP-seq
MIRT1507549	hsa-miR-548i	CLIP-seq
MIRT1507550	hsa-miR-548j	CLIP-seq
MIRT1507551	hsa-miR-548v	CLIP-seq
MIRT1507552	hsa-miR-548w	CLIP-seq
MIRT1507553	hsa-miR-548y	CLIP-seq
MIRT1507554	hsa-miR-559	CLIP-seq
MIRT1507558	hsa-miR-618	CLIP-seq
MIRT1507561	hsa-miR-802	CLIP-seq
MIRT1507562	hsa-miR-920	CLIP-seq
MIRT1507563	hsa-miR-939	CLIP-seq
MIRT1507564	hsa-miR-98	CLIP-seq
MIRT1507538	hsa-miR-4636	CLIP-seq
MIRT1507537	hsa-miR-4540	CLIP-seq
MIRT1507510	hsa-let-7a	CLIP-seq
MIRT1507511	hsa-let-7b	CLIP-seq
MIRT1507512	hsa-let-7c	CLIP-seq
MIRT1507513	hsa-let-7d	CLIP-seq
MIRT1507514	hsa-let-7e	CLIP-seq
MIRT1507515	hsa-let-7f	CLIP-seq
MIRT1507516	hsa-let-7g	CLIP-seq
MIRT1507517	hsa-let-7i	CLIP-seq
MIRT1507519	hsa-miR-196a	CLIP-seq
MIRT1507520	hsa-miR-196b	CLIP-seq
MIRT1507521	hsa-miR-202	CLIP-seq
MIRT1507524	hsa-miR-2861	CLIP-seq
MIRT1507526	hsa-miR-299-5p	CLIP-seq
MIRT1507529	hsa-miR-3670	CLIP-seq
MIRT1507533	hsa-miR-4300	CLIP-seq
MIRT1507535	hsa-miR-4458	CLIP-seq
MIRT1507536	hsa-miR-4500	CLIP-seq
MIRT1507537	hsa-miR-4540	CLIP-seq
MIRT1507538	hsa-miR-4636	CLIP-seq
MIRT1507541	hsa-miR-4794	CLIP-seq
MIRT1507542	hsa-miR-548a-5p	CLIP-seq
MIRT1507543	hsa-miR-548ab	CLIP-seq
MIRT1507544	hsa-miR-548ak	CLIP-seq
MIRT1507545	hsa-miR-548b-5p	CLIP-seq
MIRT1507546	hsa-miR-548c-5p	CLIP-seq
MIRT1507547	hsa-miR-548d-5p	CLIP-seq
MIRT1507548	hsa-miR-548h	CLIP-seq
MIRT1507549	hsa-miR-548i	CLIP-seq
MIRT1507550	hsa-miR-548j	CLIP-seq
MIRT1507551	hsa-miR-548v	CLIP-seq
MIRT1507552	hsa-miR-548w	CLIP-seq
MIRT1507553	hsa-miR-548y	CLIP-seq
MIRT1507554	hsa-miR-559	CLIP-seq
MIRT1507558	hsa-miR-618	CLIP-seq
MIRT1507561	hsa-miR-802	CLIP-seq
MIRT1507562	hsa-miR-920	CLIP-seq
MIRT1507563	hsa-miR-939	CLIP-seq
MIRT1507564	hsa-miR-98	CLIP-seq
MIRT1507510	hsa-let-7a	CLIP-seq
MIRT1507511	hsa-let-7b	CLIP-seq
MIRT1507512	hsa-let-7c	CLIP-seq
MIRT1507513	hsa-let-7d	CLIP-seq
MIRT1507514	hsa-let-7e	CLIP-seq
MIRT1507515	hsa-let-7f	CLIP-seq
MIRT1507516	hsa-let-7g	CLIP-seq
MIRT1507517	hsa-let-7i	CLIP-seq
MIRT1507518	hsa-miR-139-5p	CLIP-seq
MIRT1507519	hsa-miR-196a	CLIP-seq
MIRT1507520	hsa-miR-196b	CLIP-seq
MIRT1507521	hsa-miR-202	CLIP-seq
MIRT1507524	hsa-miR-2861	CLIP-seq
MIRT1507526	hsa-miR-299-5p	CLIP-seq
MIRT1507527	hsa-miR-3120-3p	CLIP-seq
MIRT1507529	hsa-miR-3670	CLIP-seq
MIRT1507533	hsa-miR-4300	CLIP-seq
MIRT1507534	hsa-miR-433	CLIP-seq
MIRT1507535	hsa-miR-4458	CLIP-seq
MIRT1507565	hsa-miR-4473	CLIP-seq
MIRT1507536	hsa-miR-4500	CLIP-seq
MIRT1507537	hsa-miR-4540	CLIP-seq
MIRT1507538	hsa-miR-4636	CLIP-seq
MIRT1507541	hsa-miR-4794	CLIP-seq
MIRT1507566	hsa-miR-512-3p	CLIP-seq
MIRT1507567	hsa-miR-520f	CLIP-seq
MIRT1507542	hsa-miR-548a-5p	CLIP-seq
MIRT1507543	hsa-miR-548ab	CLIP-seq
MIRT1507544	hsa-miR-548ak	CLIP-seq
MIRT1507545	hsa-miR-548b-5p	CLIP-seq
MIRT1507546	hsa-miR-548c-5p	CLIP-seq
MIRT1507547	hsa-miR-548d-5p	CLIP-seq
MIRT1507548	hsa-miR-548h	CLIP-seq
MIRT1507549	hsa-miR-548i	CLIP-seq
MIRT1507550	hsa-miR-548j	CLIP-seq
MIRT1507551	hsa-miR-548v	CLIP-seq
MIRT1507552	hsa-miR-548w	CLIP-seq
MIRT1507553	hsa-miR-548y	CLIP-seq
MIRT1507554	hsa-miR-559	CLIP-seq
MIRT1507558	hsa-miR-618	CLIP-seq
MIRT2666074	hsa-miR-621	CLIP-seq
MIRT1507561	hsa-miR-802	CLIP-seq
MIRT1507562	hsa-miR-920	CLIP-seq
MIRT1507563	hsa-miR-939	CLIP-seq
MIRT1507564	hsa-miR-98	CLIP-seq
MIRT1507518	hsa-miR-139-5p	CLIP-seq
MIRT1507524	hsa-miR-2861	CLIP-seq
MIRT1507526	hsa-miR-299-5p	CLIP-seq
MIRT1507527	hsa-miR-3120-3p	CLIP-seq
MIRT1507529	hsa-miR-3670	CLIP-seq
MIRT1507533	hsa-miR-4300	CLIP-seq
MIRT1507537	hsa-miR-4540	CLIP-seq
MIRT1507538	hsa-miR-4636	CLIP-seq
MIRT1507541	hsa-miR-4794	CLIP-seq
MIRT1507542	hsa-miR-548a-5p	CLIP-seq
MIRT1507543	hsa-miR-548ab	CLIP-seq
MIRT1507544	hsa-miR-548ak	CLIP-seq
MIRT1507545	hsa-miR-548b-5p	CLIP-seq
MIRT1507546	hsa-miR-548c-5p	CLIP-seq
MIRT1507547	hsa-miR-548d-5p	CLIP-seq
MIRT1507548	hsa-miR-548h	CLIP-seq
MIRT1507549	hsa-miR-548i	CLIP-seq
MIRT1507550	hsa-miR-548j	CLIP-seq
MIRT1507551	hsa-miR-548v	CLIP-seq
MIRT1507552	hsa-miR-548w	CLIP-seq
MIRT1507553	hsa-miR-548y	CLIP-seq
MIRT1507554	hsa-miR-559	CLIP-seq
MIRT1507558	hsa-miR-618	CLIP-seq
MIRT1507561	hsa-miR-802	CLIP-seq
MIRT1507562	hsa-miR-920	CLIP-seq
MIRT1507563	hsa-miR-939	CLIP-seq

Gene ontology (GO) Show/Hide all (9)

GO ID	Ontology	Definition	Evidence	Reference
GO:0003676	Function	Nucleic acid binding	IEA
GO:0003723	Function	RNA binding	HDA	22658674
GO:0005634	Component	Nucleus	IEA
GO:0005654	Component	Nucleoplasm	IDA
GO:0005730	Component	Nucleolus	IBA
GO:0005730	Component	Nucleolus	IDA
GO:0005730	Component	Nucleolus	IEA
GO:0008270	Function	Zinc ion binding	IEA
GO:0046872	Function	Metal ion binding	IEA

Other IDs

• MIM: 620382
• HGNC: 25424
• e!Ensembl: ENSG00000131732

Protein

• UniProt ID: Q8N567
• Protein name: Zinc finger CCHC domain-containing protein 9
• Protein function: May down-regulate transcription mediated by NF-kappa-B and the serum response element.
• Family and domains:

  Pfam

  Accession	ID	Position in sequence	Description	Type
  PF00098	zf-CCHC	184 → 201	Zinc knuckle	Domain
  PF00098	zf-CCHC	211 → 228	Zinc knuckle	Domain

• Sequence:

  MTRWARVSTTYNKRPLPATSWEDMKKGSFEGTSQNLPKRKQLEANRLSLKNDAPQAKHKK
  NKKKKEYLNEDVNGFMEYLRQNSQMVHNGQIIATDSEEVREEIAVALKKDSRREGRRLKR
  QAAKKNAMVCFHCRKPGHGIADCPAALENQDMGTGICYRCGSTEHEITKCKAKVDPALGE
  FPFAKCFVCGEMGHLSRSCPDNPKGLYADGGGCKLCGSVEHLKKDCPESQNSERMVTVGR
  WAKGMSADYEEILDVPKPQKPKTKIPKVVNF

• Sequence length: 271

Related Genes

No strongly related genes found yet for ZCCHC9.

Diseases Linked via Similar Genes

No additional diseases found yet through genes similar to ZCCHC9.