SSH1 (slingshot protein phosphatase 1)
Log in to bookmark this gene
Bookmark This Gene
|
Gene
Gene information from NCBI Gene database.
|
|
| Entrez ID | 54434 |
| Gene name | Slingshot protein phosphatase 1 |
| Gene symbol | SSH1 |
| Synonyms (NCBI Gene) |
SSH1L
|
| Chromosome | 12 |
| Chromosome location | 12q24.11 |
| Summary | The protein encoded by this gene belongs to the slingshot homolog (SSH) family of phosphatases, which regulate actin filament dynamics. The SSH proteins dephosphorylate and activate the actin binding/depolymerizing factor cofilin, which subsequently binds |
|
miRNA
miRNA information provided by mirtarbase database.
998
Show/Hide all (998) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Gene ontology (GO)
Gene Ontology (GO) annotations describing the biological processes, molecular functions, and cellular components associated with a gene.
37
Show/Hide all (37) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Other IDs
Other IDs provides unique identifiers for this gene in OMIM, HGNC, and Ensembl databases.
|
|||||||
|
|||||||
|
Protein
Protein information from UniProt database.
|
||||||||||||||||
|
UniProt ID
Unique identifier for the protein in the UniProt database. Click to view detailed protein information.
|
Q8WYL5 | |||||||||||||||
| Protein name | Protein phosphatase Slingshot homolog 1 (EC 3.1.3.16) (EC 3.1.3.48) (SSH-like protein 1) (SSH-1L) (hSSH-1L) | |||||||||||||||
| Protein function | Protein phosphatase which regulates actin filament dynamics. Dephosphorylates and activates the actin binding/depolymerizing factor cofilin, which subsequently binds to actin filaments and stimulates their disassembly. Inhibitory phosphorylation | |||||||||||||||
| Family and domains |
Pfam
|
|||||||||||||||
| Sequence |
MALVTLQRSPTPSAASSSASNSELEAGSEEDRKLNLSLSESFFMVKGAALFLQQGSSPQG |
|||||||||||||||
| Sequence length | 1049 | |||||||||||||||
| Interactions | View interactions | |||||||||||||||
|
Pathways
Pathway information has different metabolic/signaling pathways associated with genes.
|
||||
|
||||
|
Associated diseases
Disease associations from ClinVar (causal & non-causal) and other databases (OMIM, Orphanet, GWAS, etc.).
7
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Evidence Score:
★☆☆☆☆ Gene-disease association found in Text Mining only
★★☆☆☆ Found in Text Mining and Unknown/Other Associations
★★★☆☆ Reported in Unknown/Other Associations across ≥2 Sources
★★★★☆ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (<5 Variants)
★★★★★ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (≥5 Variants)
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Diseases Linked via Similar Genes
Diseases curated for genes most similar to SSH1 (see Related Genes above), that are NOT already directly curated for SSH1 itself -- a lead worth checking, not a confirmed association.
5
|
|||||||||||||||||||
|
Diabetes mellitus type 2
Linked via 3 of 5 related genesSSH2, DLG2, LIMK2
Osteoarthritis
Linked via 2 of 5 related genesSSH3, DLG2
Obstructive pulmonary disease
Linked via 2 of 5 related genesSSH2, DLG2
Insomnia
Linked via 2 of 5 related genesSSH2, DLG2
Metabolic syndrome
Linked via 2 of 5 related genesSSH2, DLG2
|
|||||||||||||||||||