SPN (sialophorin)
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Gene
Gene information from NCBI Gene database.
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| Entrez ID | 6693 |
| Gene name | Sialophorin |
| Gene symbol | SPN |
| Synonyms (NCBI Gene) |
CD43GALGPGPL115LEU-22LSN
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| Chromosome | 16 |
| Chromosome location | 16p11.2 |
| Summary | This gene encodes a highly sialylated glycoprotein that functions in antigen-specific activation of T cells, and is found on the surface of thymocytes, T lymphocytes, monocytes, granulocytes, and some B lymphocytes. It contains a mucin-like extracellular |
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miRNA
miRNA information provided by mirtarbase database.
1071
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Transcription factors
Transcription factors information provided by TRRUST V2 database.
1
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Gene ontology (GO)
Gene Ontology (GO) annotations describing the biological processes, molecular functions, and cellular components associated with a gene.
59
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Other IDs
Other IDs provides unique identifiers for this gene in OMIM, HGNC, and Ensembl databases.
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Protein
Protein information from UniProt database.
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UniProt ID
Unique identifier for the protein in the UniProt database. Click to view detailed protein information.
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P16150 |
| Protein name | Leukosialin (GPL115) (Galactoglycoprotein) (GALGP) (Leukocyte sialoglycoprotein) (Sialophorin) (CD antigen CD43) [Cleaved into: CD43 cytoplasmic tail (CD43-ct) (CD43ct)] |
| Protein function | Predominant cell surface sialoprotein of leukocytes which regulates multiple T-cell functions, including T-cell activation, proliferation, differentiation, trafficking and migration. Positively regulates T-cell trafficking to lymph-nodes via its |
| Family and domains | |
| Tissue specificity | TISSUE SPECIFICITY: Cell surface of thymocytes, T-lymphocytes, neutrophils, plasma cells and myelomas. |
| Sequence |
MATLLLLLGVLVVSPDALGSTTAVQTPTSGEPLVSTSEPLSSKMYTTSITSDPKADSTGD |
| Sequence length | 400 |
| Interactions | View interactions |
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Pathways
Pathway information has different metabolic/signaling pathways associated with genes.
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Associated diseases
Disease associations from ClinVar (causal & non-causal) and other databases (OMIM, Orphanet, GWAS, etc.).
5
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Evidence Score:
★☆☆☆☆ Gene-disease association found in Text Mining only
★★☆☆☆ Found in Text Mining and Unknown/Other Associations
★★★☆☆ Reported in Unknown/Other Associations across ≥2 Sources
★★★★☆ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (<5 Variants)
★★★★★ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (≥5 Variants)
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Diseases Linked via Similar Genes
Diseases curated for genes most similar to SPN (see Related Genes above), that are NOT already directly curated for SPN itself -- a lead worth checking, not a confirmed association.
5
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Fatty liver
Linked via 1 of 5 related genesRIPK3
Fatty liver, alcoholic
Linked via 1 of 5 related genesRIPK3
Juvenile arthritis
Linked via 1 of 5 related genesFCGR1A
Juvenile idiopathic arthritis
Linked via 1 of 5 related genesFCGR1A
Oligoarticular juvenile idiopathic arthritis
Linked via 1 of 5 related genesFCGR1A
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