SPIN1 (spindlin 1)
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Gene
Gene information from NCBI Gene database.
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| Entrez ID | 10927 |
| Gene name | Spindlin 1 |
| Gene symbol | SPIN1 |
| Synonyms (NCBI Gene) |
SPINTDRD24
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| Chromosome | 9 |
| Chromosome location | 9q22.1 |
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miRNA
miRNA information provided by mirtarbase database.
1262
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Gene ontology (GO)
Gene Ontology (GO) annotations describing the biological processes, molecular functions, and cellular components associated with a gene.
28
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Other IDs
Other IDs provides unique identifiers for this gene in OMIM, HGNC, and Ensembl databases.
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Protein
Protein information from UniProt database.
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UniProt ID
Unique identifier for the protein in the UniProt database. Click to view detailed protein information.
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Q9Y657 | ||||||||||||||||||||
| Protein name | Spindlin-1 (Ovarian cancer-related protein) (Spindlin1) | ||||||||||||||||||||
| Protein function | Chromatin reader that specifically recognizes and binds histone H3 both trimethylated at 'Lys-4' and 'Lys-9' (H3K4me3K9me3) and is involved in piRNA-mediated retrotransposon silencing during spermatogenesis (PubMed:33574238). Plays a key role in | ||||||||||||||||||||
| PDB | 2NS2 , 4H75 , 4MZF , 4MZG , 4MZH , 5JSG , 5JSJ , 5Y5W , 6I8B , 6I8L , 6I8Y , 6QPL , 7BQZ , 7BU9 , 7CNA , 7E9M , 7EA1 , 7OCB , 8GTX | ||||||||||||||||||||
| Family and domains |
Pfam
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| Tissue specificity | TISSUE SPECIFICITY: Highly expressed in ovarian cancer tissues. {ECO:0000269|PubMed:22258766}. | ||||||||||||||||||||
| Sequence |
MKTPFGKTPGQRSRADAGHAGVSANMMKKRTSHKKHRSSVGPSKPVSQPRRNIVGCRIQH |
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| Sequence length | 262 | ||||||||||||||||||||
| Interactions | View interactions | ||||||||||||||||||||
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Associated diseases
Disease associations from ClinVar (causal & non-causal) and other databases (OMIM, Orphanet, GWAS, etc.).
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Evidence Score:
★☆☆☆☆ Gene-disease association found in Text Mining only
★★☆☆☆ Found in Text Mining and Unknown/Other Associations
★★★☆☆ Reported in Unknown/Other Associations across ≥2 Sources
★★★★☆ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (<5 Variants)
★★★★★ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (≥5 Variants)
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Related Genes
Genes most often co-reported with SPIN1 across shared curated disease and pathway associations.
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No strongly related genes found yet for SPIN1. |
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Diseases Linked via Similar Genes
Diseases curated for genes most similar to SPIN1 (see Related Genes above), that are NOT already directly curated for SPIN1 itself -- a lead worth checking, not a confirmed association.
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No additional diseases found yet through genes similar to SPIN1. |