SP1 (Sp1 transcription factor)
Log in to bookmark this gene
Bookmark This Gene
|
Gene
Gene information from NCBI Gene database.
|
|
| Entrez ID | 6667 |
| Gene name | Sp1 transcription factor |
| Gene symbol | SP1 |
| Synonyms (NCBI Gene) |
-
|
| Chromosome | 12 |
| Chromosome location | 12q13.13 |
| Summary | The protein encoded by this gene is a zinc finger transcription factor that binds to GC-rich motifs of many promoters. The encoded protein is involved in many cellular processes, including cell differentiation, cell growth, apoptosis, immune responses, re |
|
miRNA
miRNA information provided by mirtarbase database.
1325
Show/Hide all (1325) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Transcription factors
Transcription factors information provided by TRRUST V2 database.
13
Show/Hide all (13) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Gene ontology (GO)
Gene Ontology (GO) annotations describing the biological processes, molecular functions, and cellular components associated with a gene.
67
Show/Hide all (67) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Other IDs
Other IDs provides unique identifiers for this gene in OMIM, HGNC, and Ensembl databases.
|
|||||||
|
|||||||
|
Protein
Protein information from UniProt database.
|
|||||||||||||||||||||
|
UniProt ID
Unique identifier for the protein in the UniProt database. Click to view detailed protein information.
|
P08047 | ||||||||||||||||||||
| Protein name | Transcription factor Sp1 | ||||||||||||||||||||
| Protein function | Transcription factor that can activate or repress transcription in response to physiological and pathological stimuli. Binds with high affinity to GC-rich motifs and regulates the expression of a large number of genes involved in a variety of pr | ||||||||||||||||||||
| PDB | 1SP1 , 1SP2 , 1VA1 , 1VA2 , 1VA3 , 6PV0 , 6PV1 , 6PV2 , 6PV3 , 6UCO , 6UCP | ||||||||||||||||||||
| Family and domains |
Pfam
|
||||||||||||||||||||
| Tissue specificity | TISSUE SPECIFICITY: Up-regulated in adenocarcinomas of the stomach (at protein level). Isoform 3 is ubiquitously expressed at low levels. {ECO:0000269|PubMed:21798247}. | ||||||||||||||||||||
| Sequence |
MSDQDHSMDEMTAVVKIEKGVGGNNGGNGNGGGAFSQARSSSTGSSSSTGGGGQESQPSP |
||||||||||||||||||||
| Sequence length | 785 | ||||||||||||||||||||
| Interactions | View interactions | ||||||||||||||||||||
|
Associated diseases
Disease associations from ClinVar (causal & non-causal) and other databases (OMIM, Orphanet, GWAS, etc.).
14
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Evidence Score:
★☆☆☆☆ Gene-disease association found in Text Mining only
★★☆☆☆ Found in Text Mining and Unknown/Other Associations
★★★☆☆ Reported in Unknown/Other Associations across ≥2 Sources
★★★★☆ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (<5 Variants)
★★★★★ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (≥5 Variants)
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Related Genes
Genes most often co-reported with SP1 across shared curated disease and pathway associations.
5
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Sort by:
TBC1D8
2 shared diseasesProgressive supranuclear palsy, Osteoporosis 2 shared evidence sourcesGWAS catalog (Osteoporosis), GWAS catalog (Progressive supranuclear palsy)
Related via 2 shared diseases including Progressive supranuclear palsy, Osteoporosis — evidence mostly GWAS catalog.
KCNH6
2 shared diseasesNon-organic psychosis, Psychotic disorders 2 shared evidence sourcesDisgenet (Non-organic psychosis), Disgenet (Psychotic disorders)
Related via 2 shared diseases including Non-organic psychosis, Psychotic disorders — evidence mostly Disgenet.
NPAS1
2 shared diseasesNon-organic psychosis, Psychotic disorders 2 shared evidence sourcesDisgenet (Non-organic psychosis), Disgenet (Psychotic disorders)
Related via 2 shared diseases including Non-organic psychosis, Psychotic disorders — evidence mostly Disgenet.
OLIG2
2 shared diseasesNon-organic psychosis, Psychotic disorders 2 shared evidence sourcesDisgenet (Non-organic psychosis), Disgenet (Psychotic disorders)
Related via 2 shared diseases including Non-organic psychosis, Psychotic disorders — evidence mostly Disgenet.
PAK5
2 shared diseasesNon-organic psychosis, Psychotic disorders 2 shared evidence sourcesDisgenet (Non-organic psychosis), Disgenet (Psychotic disorders)
Related via 2 shared diseases including Non-organic psychosis, Psychotic disorders — evidence mostly Disgenet.
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Diseases Linked via Similar Genes
Diseases curated for genes most similar to SP1 (see Related Genes above), that are NOT already directly curated for SP1 itself -- a lead worth checking, not a confirmed association.
5
|
|||||||||||||||||||
|
Gout
Linked via 1 of 5 related genesTBC1D8
Rheumatoid arthritis
Linked via 1 of 5 related genesTBC1D8
Attention deficit hyperactivity disorder
Linked via 1 of 5 related genesNPAS1
Autism
Linked via 1 of 5 related genesNPAS1
Bipolar disorder
Linked via 1 of 5 related genesPAK5
|
|||||||||||||||||||