OTUD4 (OTU deubiquitinase 4)
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Gene
Gene information from NCBI Gene database.
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| Entrez ID | 54726 |
| Gene name | OTU deubiquitinase 4 |
| Gene symbol | OTUD4 |
| Synonyms (NCBI Gene) |
DUBA6HIN1HSHIN1
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| Chromosome | 4 |
| Chromosome location | 4q31.21 |
| Summary | Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. The smaller protein isoform encoded by the shorter transcript variant is found only in HIV-1 infected cells. [provided by RefSeq, Jul 2010] |
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miRNA
miRNA information provided by mirtarbase database.
1159
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Gene ontology (GO)
Gene Ontology (GO) annotations describing the biological processes, molecular functions, and cellular components associated with a gene.
34
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Other IDs
Other IDs provides unique identifiers for this gene in OMIM, HGNC, and Ensembl databases.
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Protein
Protein information from UniProt database.
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UniProt ID
Unique identifier for the protein in the UniProt database. Click to view detailed protein information.
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Q01804 | ||||||||||
| Protein name | OTU domain-containing protein 4 (EC 3.4.19.12) (HIV-1-induced protein HIN-1) | ||||||||||
| Protein function | Deubiquitinase which hydrolyzes the isopeptide bond between the ubiquitin C-terminus and the lysine epsilon-amino group of the target protein (PubMed:23827681, PubMed:25944111, PubMed:29395066). May negatively regulate inflammatory and pathogen | ||||||||||
| Family and domains |
Pfam
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| Sequence |
MEAAVGVPDGGDQGGAGPREDATPMDAYLRKLGLYRKLVAKDGSCLFRAVAEQVLHSQSR |
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| Sequence length | 1114 | ||||||||||
| Interactions | View interactions | ||||||||||
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Associated diseases
Disease associations from ClinVar (causal & non-causal) and other databases (OMIM, Orphanet, GWAS, etc.).
13
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Evidence Score:
★☆☆☆☆ Gene-disease association found in Text Mining only
★★☆☆☆ Found in Text Mining and Unknown/Other Associations
★★★☆☆ Reported in Unknown/Other Associations across ≥2 Sources
★★★★☆ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (<5 Variants)
★★★★★ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (≥5 Variants)
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Related Genes
Genes most often co-reported with OTUD4 across shared curated disease and pathway associations.
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No strongly related genes found yet for OTUD4. |
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Diseases Linked via Similar Genes
Diseases curated for genes most similar to OTUD4 (see Related Genes above), that are NOT already directly curated for OTUD4 itself -- a lead worth checking, not a confirmed association.
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No additional diseases found yet through genes similar to OTUD4. |