CTDSP2 (CTD small phosphatase 2)
Log in to bookmark this gene
Bookmark This Gene
|
Gene
Gene information from NCBI Gene database.
|
|
| Entrez ID | 10106 |
| Gene name | CTD small phosphatase 2 |
| Gene symbol | CTDSP2 |
| Synonyms (NCBI Gene) |
OS4PSR2SCP2
|
| Chromosome | 12 |
| Chromosome location | 12q14.1 |
|
miRNA
miRNA information provided by mirtarbase database.
1104
Show/Hide all (1104) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Gene ontology (GO)
Gene Ontology (GO) annotations describing the biological processes, molecular functions, and cellular components associated with a gene.
14
Show/Hide all (14) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Other IDs
Other IDs provides unique identifiers for this gene in OMIM, HGNC, and Ensembl databases.
|
|||||||
|
|||||||
|
Protein
Protein information from UniProt database.
|
|||||||||||
|
UniProt ID
Unique identifier for the protein in the UniProt database. Click to view detailed protein information.
|
O14595 | ||||||||||
| Protein name | Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2 (EC 3.1.3.16) (Nuclear LIM interactor-interacting factor 2) (NLI-interacting factor 2) (Protein OS-4) (Small C-terminal domain phosphatase 2) (Small CTD phosphatase 2) (SCP2) | ||||||||||
| Protein function | Preferentially catalyzes the dephosphorylation of 'Ser-5' within the tandem 7 residue repeats in the C-terminal domain (CTD) of the largest RNA polymerase II subunit POLR2A. Negatively regulates RNA polymerase II transcription, possibly by contr | ||||||||||
| PDB | 2Q5E | ||||||||||
| Family and domains |
Pfam
|
||||||||||
| Tissue specificity | TISSUE SPECIFICITY: Expression is restricted to non-neuronal tissues. Highest expression in pancreas and lowest in liver. {ECO:0000269|PubMed:15681389}. | ||||||||||
| Sequence |
MEHGSIITQARREDALVLTKQGLVSKSSPKKPRGRNIFKALFCCFRAQHVGQSSSSTELA |
||||||||||
| Sequence length | 271 | ||||||||||
| Interactions | View interactions | ||||||||||
|
Pathways
Pathway information has different metabolic/signaling pathways associated with genes.
|
|||
|
|||
|
Associated diseases
Disease associations from ClinVar (causal & non-causal) and other databases (OMIM, Orphanet, GWAS, etc.).
9
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Evidence Score:
★☆☆☆☆ Gene-disease association found in Text Mining only
★★☆☆☆ Found in Text Mining and Unknown/Other Associations
★★★☆☆ Reported in Unknown/Other Associations across ≥2 Sources
★★★★☆ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (<5 Variants)
★★★★★ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (≥5 Variants)
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Related Genes
Genes most often co-reported with CTDSP2 across shared curated disease and pathway associations.
0
|
|
|
No strongly related genes found yet for CTDSP2. |
|
Diseases Linked via Similar Genes
Diseases curated for genes most similar to CTDSP2 (see Related Genes above), that are NOT already directly curated for CTDSP2 itself -- a lead worth checking, not a confirmed association.
0
|
|
|
No additional diseases found yet through genes similar to CTDSP2. |