CLEC2D (C-type lectin domain family 2 member D)
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Gene
Gene information from NCBI Gene database.
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| Entrez ID | 29121 |
| Gene name | C-type lectin domain family 2 member D |
| Gene symbol | CLEC2D |
| Synonyms (NCBI Gene) |
CLAXLLT1OCIL
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| Chromosome | 12 |
| Chromosome location | 12p13.31 |
| Summary | This gene encodes a member of the natural killer cell receptor C-type lectin family. The encoded protein inhibits osteoclast formation and contains a transmembrane domain near the N-terminus as well as the C-type lectin-like extracellular domain. Several |
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miRNA
miRNA information provided by mirtarbase database.
963
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Gene ontology (GO)
Gene Ontology (GO) annotations describing the biological processes, molecular functions, and cellular components associated with a gene.
12
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Other IDs
Other IDs provides unique identifiers for this gene in OMIM, HGNC, and Ensembl databases.
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Protein
Protein information from UniProt database.
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UniProt ID
Unique identifier for the protein in the UniProt database. Click to view detailed protein information.
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Q9UHP7 | ||||||||||
| Protein name | C-type lectin domain family 2 member D (Lectin-like NK cell receptor) (Lectin-like transcript 1) (LLT-1) (Osteoclast inhibitory lectin) | ||||||||||
| Protein function | Receptor for KLRB1 that protects target cells against natural killer cell-mediated lysis (PubMed:16339513, PubMed:20843815). Inhibits osteoclast formation (PubMed:14753741, PubMed:15123656). Inhibits bone resorption (PubMed:14753741). Modulates | ||||||||||
| PDB | 4QKG , 4QKH , 4QKI , 4QKJ , 4WCO , 5MGT | ||||||||||
| Family and domains |
Pfam
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| Tissue specificity | TISSUE SPECIFICITY: Detected in peripheral blood leukocytes, osteoblasts, lymph node, thymus and spleen. Isoform 1, isoform 2 and isoform 4 are expressed in T- and B-lymphocytes, and at lower levels in NK cells. They are also expressed in B-cell lines and | ||||||||||
| Sequence |
MHDSNNVEKDITPSELPANPGCLHSKEHSIKATLIWRLFFLIMFLTIIVCGMVAALSAIR |
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| Sequence length | 191 | ||||||||||
| Interactions | View interactions | ||||||||||
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Pathways
Pathway information has different metabolic/signaling pathways associated with genes.
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Associated diseases
Disease associations from ClinVar (causal & non-causal) and other databases (OMIM, Orphanet, GWAS, etc.).
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Evidence Score:
★☆☆☆☆ Gene-disease association found in Text Mining only
★★☆☆☆ Found in Text Mining and Unknown/Other Associations
★★★☆☆ Reported in Unknown/Other Associations across ≥2 Sources
★★★★☆ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (<5 Variants)
★★★★★ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (≥5 Variants)
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Related Genes
Genes most often co-reported with CLEC2D across shared curated disease and pathway associations.
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No strongly related genes found yet for CLEC2D. |
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Diseases Linked via Similar Genes
Diseases curated for genes most similar to CLEC2D (see Related Genes above), that are NOT already directly curated for CLEC2D itself -- a lead worth checking, not a confirmed association.
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No additional diseases found yet through genes similar to CLEC2D. |