ATG2A (autophagy related 2A)
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Gene
Gene information from NCBI Gene database.
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| Entrez ID | 23130 |
| Gene name | Autophagy related 2A |
| Gene symbol | ATG2A |
| Synonyms (NCBI Gene) |
BLTP4A
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| Chromosome | 11 |
| Chromosome location | 11q13.1 |
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miRNA
miRNA information provided by mirtarbase database.
1040
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Gene ontology (GO)
Gene Ontology (GO) annotations describing the biological processes, molecular functions, and cellular components associated with a gene.
25
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Other IDs
Other IDs provides unique identifiers for this gene in OMIM, HGNC, and Ensembl databases.
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Protein
Protein information from UniProt database.
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UniProt ID
Unique identifier for the protein in the UniProt database. Click to view detailed protein information.
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Q2TAZ0 | |||||||||||||||
| Protein name | Autophagy-related protein 2 homolog A | |||||||||||||||
| Protein function | Lipid transfer protein involved in autophagosome assembly (PubMed:28561066, PubMed:30952800, PubMed:31271352). Tethers the edge of the isolation membrane (IM) to the endoplasmic reticulum (ER) and mediates direct lipid transfer from ER to IM for | |||||||||||||||
| PDB | 6KLR , 8KBX , 8KBY , 8KC3 , 8SBK , 8SBL , 8Y1L | |||||||||||||||
| Family and domains |
Pfam
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| Sequence |
MSRWLWPWSNCVKERVCRYLLHHYLGHFFQEHLSLDQLSLDLYKGSVALRDIHLEIWSVN |
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| Sequence length | 1938 | |||||||||||||||
| Interactions | View interactions | |||||||||||||||
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Pathways
Pathway information has different metabolic/signaling pathways associated with genes.
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Associated diseases
Disease associations from ClinVar (causal & non-causal) and other databases (OMIM, Orphanet, GWAS, etc.).
10
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Evidence Score:
★☆☆☆☆ Gene-disease association found in Text Mining only
★★☆☆☆ Found in Text Mining and Unknown/Other Associations
★★★☆☆ Reported in Unknown/Other Associations across ≥2 Sources
★★★★☆ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (<5 Variants)
★★★★★ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (≥5 Variants)
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Diseases Linked via Similar Genes
Diseases curated for genes most similar to ATG2A (see Related Genes above), that are NOT already directly curated for ATG2A itself -- a lead worth checking, not a confirmed association.
5
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Lung neoplasms
Linked via 2 of 5 related genesIGBP1, ATG101
Dementia
Linked via 1 of 5 related genesATG2B
Esophageal cancer
Linked via 1 of 5 related genesATG2B
Gastric cancer
Linked via 1 of 5 related genesATG2B
Heart disease
Linked via 1 of 5 related genesATG2B
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