AGFG1 (ArfGAP with FG repeats 1)
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Gene
Gene information from NCBI Gene database.
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| Entrez ID | 3267 |
| Gene name | ArfGAP with FG repeats 1 |
| Gene symbol | AGFG1 |
| Synonyms (NCBI Gene) |
HRBRABRIP
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| Chromosome | 2 |
| Chromosome location | 2q36.3 |
| Summary | The protein encoded by this gene is related to nucleoporins, a class of proteins that mediate nucleocytoplasmic transport. The encoded protein binds the activation domain of the human immunodeficiency virus Rev protein when Rev is assembled onto its RNA t |
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miRNA
miRNA information provided by mirtarbase database.
629
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Gene ontology (GO)
Gene Ontology (GO) annotations describing the biological processes, molecular functions, and cellular components associated with a gene.
25
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Other IDs
Other IDs provides unique identifiers for this gene in OMIM, HGNC, and Ensembl databases.
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Protein
Protein information from UniProt database.
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UniProt ID
Unique identifier for the protein in the UniProt database. Click to view detailed protein information.
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P52594 | ||||||||||
| Protein name | Arf-GAP domain and FG repeat-containing protein 1 (HIV-1 Rev-binding protein) (Nucleoporin-like protein RIP) (Rev-interacting protein) (Rev/Rex activation domain-binding protein) | ||||||||||
| Protein function | Required for vesicle docking or fusion during acrosome biogenesis (By similarity). May play a role in RNA trafficking or localization. In case of infection by HIV-1, acts as a cofactor for viral Rev and promotes movement of Rev-responsive elemen | ||||||||||
| PDB | 2D9L , 2OLM , 2VX8 | ||||||||||
| Family and domains |
Pfam
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| Tissue specificity | TISSUE SPECIFICITY: Ubiquitously expressed. {ECO:0000269|PubMed:7634337}. | ||||||||||
| Sequence |
MAASAKRKQEEKHLKMLRDMTGLPHNRKCFDCDQRGPTYVNMTVGSFVCTSCSGSLRGLN |
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| Sequence length | 562 | ||||||||||
| Interactions | View interactions | ||||||||||
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Pathways
Pathway information has different metabolic/signaling pathways associated with genes.
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Diseases Linked via Similar Genes
Diseases curated for genes most similar to AGFG1 (see Related Genes above), that are NOT already directly curated for AGFG1 itself -- a lead worth checking, not a confirmed association.
5
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Coronary artery disease
Linked via 3 of 5 related genesFCHO2, AAK1, FCHO1
Periodontal disease
Linked via 2 of 5 related genesFCHO2, AAK1
Periodontitis
Linked via 2 of 5 related genesFCHO2, AAK1
Post-operative atrial fibrillation
Linked via 1 of 5 related genesSTON1
Amyotrophic lateral sclerosis
Linked via 1 of 5 related genesSTON1
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