RNF38 (ring finger protein 38)
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Gene
Gene information from NCBI Gene database.
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| Entrez ID | 152006 |
| Gene name | Ring finger protein 38 |
| Gene symbol | RNF38 |
| Synonyms (NCBI Gene) |
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| Chromosome | 9 |
| Chromosome location | 9p13.2 |
| Summary | This gene encodes a protein with a coiled-coil motif and a RING-H2 motif (C3H2C2) at its carboxy-terminus. The RING motif is a zinc-binding domain found in a large set of proteins playing roles in diverse cellular processes including oncogenesis, developm |
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miRNA
miRNA information provided by mirtarbase database.
1125
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Gene ontology (GO)
Gene Ontology (GO) annotations describing the biological processes, molecular functions, and cellular components associated with a gene.
15
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Other IDs
Other IDs provides unique identifiers for this gene in OMIM, HGNC, and Ensembl databases.
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Protein
Protein information from UniProt database.
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UniProt ID
Unique identifier for the protein in the UniProt database. Click to view detailed protein information.
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Q9H0F5 | ||||||||||
| Protein name | E3 ubiquitin-protein ligase RNF38 (EC 2.3.2.27) (RING finger protein 38) (RING-type E3 ubiquitin transferase RNF38) | ||||||||||
| Protein function | Acts as an E3 ubiquitin-protein ligase able to ubiquitinate p53/TP53 which promotes its relocalization to discrete foci associated with PML nuclear bodies. Exhibits preference for UBE2D2 as a E2 enzyme. | ||||||||||
| PDB | 1X4J , 4V3K , 4V3L , 7OJX | ||||||||||
| Family and domains |
Pfam
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| Tissue specificity | TISSUE SPECIFICITY: Widely expressed with highest levels in testis. {ECO:0000269|PubMed:12074600}. | ||||||||||
| Sequence |
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| Sequence length | 515 | ||||||||||
| Interactions | View interactions | ||||||||||
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Associated diseases
Disease associations from ClinVar (causal & non-causal) and other databases (OMIM, Orphanet, GWAS, etc.).
4
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Evidence Score:
★☆☆☆☆ Gene-disease association found in Text Mining only
★★☆☆☆ Found in Text Mining and Unknown/Other Associations
★★★☆☆ Reported in Unknown/Other Associations across ≥2 Sources
★★★★☆ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (<5 Variants)
★★★★★ ClinVar: Pathogenic/Likely Pathogenic (≥5 Variants)
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